谷歌AI可预测新冠病毒蛋白质结构 或有助于遏制全球爆发

2020-03-06 18:03:15爱云资讯

据最新统计,世界各地的科学家都在竭尽全力了解这种新病毒,DeepMind的发现希望减少确定病毒蛋白质结构的时间。

图:谷歌旗下人工智能研究公司DeepMind首席执行官戴密斯·哈萨比斯(Demis Hassabis)

3月6日消息,据外媒报道,谷歌旗下人工智能(AI)部门DeepMind正在加入全球努力,以帮助了解更多关于新型冠状病毒的信息,这种病毒引发的疫情正在世界大部分地区迅速传播。

谷歌的英国研究团队刚刚使用DeepMind的新深度学习系统AlphaFold预测新型冠状病毒的蛋白质结构。该系统使用被称为“自由建模”的机器学习技术,当没有类似的蛋白质结构可用时,它可以自主生成新的蛋白质结构。

据最新统计,世界各地的科学家都在竭尽全力了解这种新病毒,DeepMind的发现希望减少确定病毒蛋白质结构的时间。

DeepMind发布的博客文章指出:“了解蛋白质结构将为了解其功能提供重要线索,但确定结构的实验往往可能需要几个月或更长的时间,有些实验甚至被证明难以获得结果。为此,研究人员始终在开发从氨基酸序列预测蛋白质结构的计算方法。在类似蛋白质的结构已经被实验确定的情况下,基于“模板建模”的算法能够提供对蛋白质结构的准确预测。”

文章中还称:“我们最近发布的深度学习系统AlphaFold专注于在没有相似蛋白质结构的情况下准确预测蛋白质结构,这种方式被称为“自由建模”。自推出以来,我们始终在持续改进这些方法,并希望提供最有用的预测,所以我们分享了使用我们新开发的方法生成的SARS-CoV-2中某些蛋白质的预测结构。”

值得注意的是,DeepMind的结构预测系统仍在开发中,他们不能确定所提供的结构的准确性,尽管他们相信该系统比早期的CASP13系统更准确。DeepMind证实,其系统为蛋白质数据库中共享的、经过实验验证的SARS-CoV-2尖峰蛋白结构提供了准确的预测,这让他们相信对其他蛋白质的模型预测可能是有用的。

鉴于“疫情的潜在严重性和时间敏感性”,DeepMind表示,该公司正在跳过通过实验验证发现的过程,或者在发表之前等待学术期刊的同行评审。这与其他科学研究相一致,因为这个过程可能需要几个月的时间。

博客文章中还称:“我们需要强调下,这些结构预测还没有经过实验验证,但希望它们能有助于科学界了解病毒是如何发挥作用的,并为未来开发疗法的实验工作提供假说生成平台。我们感谢许多其他实验室的工作:如果没有全球研究人员的努力,这项工作是不可能完成的。”

文章补充道:“通常情况下,我们会等到一家学术期刊对这项工作进行同行审查后再发表相关发现。然而,考虑到情况的潜在严重性和时间敏感性,我们将按照现在的情况发布预测的结构,并以开源的形式推出,这样任何人都可以使用它们。”开源将允许任何研究人员在DeepMind发现的基础上进行改进或分享。

谷歌在2014年斥资4亿英镑收购了总部位于伦敦的DeepMind,该公司此前曾使用AI推动医疗保健领域的进步,开发用于识别眼病和检测宫颈癌的模型。

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