AI技术运用基因测序 助力基因组计划

新年伊始,号称引领全球基因组学的英国政府宣布在接下来五年内将完成“100万人组基因计划”;美国政府也在两年前宣布启动为期十年的任何18岁以上美国人都可以参与的“all of us”基因组计划;2016年12月中国启动“中国十万人基因组计划”……各国政府纷纷启动了自己国家的大规模基因组计划,开始朝着精准医疗的目标迈进。

记者从有关渠道获悉,近一年多来我国地方政府也纷纷启动基因组测序计划:江苏、福建已经启动百万基因组测序计划,而在北京更大范围的基因测序也在进行。有关预计显示,2020年我国基因测序市场规模将达到180亿元,约占世界基因测序市场总规模的1/5。不少科技公司看准基因大数据行业爆发性增长趋势,开始积极布局抢占基因测序市场。除了华大基因之外,人工智能企业也在跃跃欲试。“我们的团队中有测序行业顶尖的生物学家,也有人工智能公司常见的算法大牛,两者结合使得我们对基因大数据的掌控更为全面。”人工智能独角兽企业深兰科技科学家表示,他们的目标是让每个人能够拥有自己的基因组数据,并通过这些数据了解自己的健康状况,医生可根据数据制定个性化健康管理方案。

“我们能够有效地帮助地方政府迅速建立大数据和方案”据介绍,深兰的病历AI系统把繁重的数据整理工作变得轻松可为,为各个合作城市建立完整中心化的电子病历和医疗数据系统。在此基础上,深兰将与各城市合作成立基因组AI研究院,协助各地医院和院校共同研发基于个人基因组的疾病预测和诊断AI模型、迅速提升医疗的智能化体系和疾病防治水平。

以深兰科技为例,从信息科学领域进入生命科学的企业屡见不鲜,大数据、云计算等信息技术正在加速融入到基因测序产业应用之中,并逐渐成为未来测序产业竞争的制高点。赛迪顾问发布的《2018中国基因测序产业演进及投资价值研究》白皮书指出,基因测序结果的临床解读依赖于大量本民族人群样本数据的分析,基因测序产生的海量数据需要强大的计算资源和先进的数据分析算法。

除了拥有全智能化和自动化的基因组测序生产线外,深兰科技在市场上推出的全基因组检测标准将依据《国际千人基因组计划》,“国际千人基因组计划”,是举世闻名的人类基因组计划的延续和发展,是基因组科学研究向临床医学迈进的重要转折点。“国际千人基因组计划”产生的数据和研究成果通过公共数据库发布,供全球科学家免费共享。“千人基因组计划”数据表明,大样本低覆盖度测序在降低成本的同时,仍然能有效覆盖人群中的基因多样性。千人基因组测序技术标准是一种全球广泛采用的全基因组测序(whole genome sequencing)国际标准。